参照: 小粋空間: Movable Type の配列とハッシュの入れ子 http://www.koikikukan.com/archives/2009/12/15-005555.php

サンプル

<mt:SetVar name="list[0]" value="0" />
<mt:SetVar name="list[1]" value="1" />
<mt:SetVar name="list[2]" value="2" />
<mt:SetVar name="foo[0]" value="$list" />

こんの部分がミソ。これで多重配列にできる

<mt:SetVar name="foo[0]" value="$list" />

keyを任意にするなら

<mt:SetVar name="foo[0]" value="$list" />